Στο Τμήμα Συγκοινωνιακών Έργων είναι αρμόδιο ιδίως για:

1. το σχεδιασμό, τη μελέτη και την κατασκευή των έργων οδοποιίας και των λιμενικών έργων καθώς και στα ζητήματα οδικής ασφάλειας που σχετίζονται με τις αρμοδιότητες της Διεύθυνσης,
2. τη μελέτη και συντήρηση τοπικών βελτιώσεων του υφιστάμενου οδικού δικτύου της Περιφέρειας,
3. τη μελέτη των έργων πρασίνου,
4. την εποπτεία οδών

Στο Τμήμα Πράξεων Περιφερειακής Σημασίας, Μελετών & Ελέγχου Ποιότητας είναι αρμόδιο ιδίως για:

1. την ωρίμανση πράξεων (έργα ή/και προμήθειες ή/και υπηρεσίες) που χαρακτηρίζονται ως περιφερειακής σημασίας με απόφαση του αρμόδιου Γενικού Διευθυντή με κριτήρια την πηγή χρηματοδότησης (ευρωπαϊκά διαρθρωτικά και ειδικά επενδυτικά ταμεία, από το πρόγραμμα δημοσίων επενδύσεων αλλά και από Συμπράξεις Συμβάσεων Δημοσίου και Ιδιωτικού Τομέα (Σ.Δ.Ι.Τ.)) ή τον σύνθετο χαρακτήρα τους. Με ίδια απόφαση μπορεί να ανατίθεται κατ’ εξαίρεση και η εκτέλεση, επίβλεψη και παραλαβή των πράξεων αυτών,

2. την τήρηση, την παρακολούθηση και τη διεκπεραίωση της διαδικασίας των διαγωνισμών ανάθεσης μελετών αρμοδιότητας του Τμήματος,

3. τη δημιουργία και τήρηση αρχείου της νομοθεσίας των έργων και μελετών και αποθετηρίου μελετών έργων περιφερειακής σημασίας,

4. την τήρηση, παρακολούθηση και διεκπεραίωση της διαδικασίας κήρυξης αναγκαστικής απαλλοτρίωσης για εκτέλεση δημοσίων έργων αρμοδιότητας της Διεύθυνσης, όταν η μελέτη κτηματογράφησης έχει εκπονηθεί από το Τμήμα ή υπό την επίβλεψη του Τμήματος κατά την εκτέλεση ανατεθείσας σύμβασης μελέτης,

5. την παρακολούθηση της εξέλιξης της σχετικής νομοθεσίας για τις προδιαγραφές των υλικών, τους τρόπους κατασκευής των δημοσίων έργων και των εγκαταστάσεών τους και διάχυση των πληροφοριών αυτών προς όλα τα Τμήματα της Διεύθυνσης,

6. την παρακολούθηση των οδηγιών κανονισμών και τεχνικών προδιαγραφών που αφορούν τα υλικά κατασκευών και τις κατασκευές έργων για την σωστή εφαρμογή τους από τα Τμήματα της Διεύθυνσης,

7. την παρακολούθηση, τον έλεγχο και τη διοίκηση συναφθείσας σύμβασης με αποκλειστικό φυσικό αντικείμενο οποιεσδήποτε μελέτες ή τεχνικές υπηρεσίες ή άλλες επιστημονικές υπηρεσίες με αρμοδιότητες «Διευθύνουσας Υπηρεσίας», υπό την εποπτεία της «Προϊσταμένης Αρχής», οι οποίες εκπονούνται με ανάθεση σε τρίτους από την Περιφέρεια και σχετίζονται με την εκτέλεση έργων που εκτελούνται ή αφορούν σε περισσότερες της μίας Περιφερειακές Ενότητες ή είναι περιφερειακού επιπέδου ή ανήκαν στην αρμοδιότητα της τέως Κρατικής Περιφέρειας

Στο Τμήμα Δομών Περιβάλλοντος και Εγγειοβελτιωτικών Έργων είναι αρμόδιο ιδίως για:

1. τη μελέτη και την εκτέλεση έργων περιβάλλοντος, έργων προστασίας ακτών, εγγειοβελτιωτικών έργων, έργων διευθέτησης / αντιπλημμυρικών έργων υδατορεμάτων και υδραυλικών έργων, καθώς και στη μελέτη, κατασκευή και συντήρηση κτιριακών, αντιπλημμυρικών και λοιπών έργων, που κατά αρμοδιότητα ανήκουν στην Διεύθυνση ή ανατίθενται μέσω Προγραμματικών Συμβάσεων στην Περιφέρεια,
2. την αστυνόμευση ποταμών και ρεμάτων αρμοδιότητας της Διεύθυνσης και των απαλλοτριωμένων χώρων παρά αυτών καθώς και την εκτέλεση έργων διευθέτησής τους,
3. τον έλεγχο και τη θεώρηση φακέλου οριοθέτησης ποταμών και υδατορεμάτων αρμοδιότητας της Διεύθυνσης,
4. τον έλεγχο και τη θεώρηση φακέλου οριοθέτησης ποταμών και υδατορεμάτων αρμοδιότητας της Διεύθυνσης όταν συντάσσεται με μέριμνα οικείου ΟΤΑ και φυσικών ή νομικών προσώπων.

Στο Τμήμα Ηλεκτροφωτισμού και Φωτεινής Σηματοδότησης είναι αρμόδιο ιδίως για:

1. τη μελέτη και την εκτέλεση των εργασιών φωτεινής σηματοδότησης και ηλεκτροφωτισμού του οδικού δικτύου αρμοδιότητάς της Διεύθυνσης και τα θέματα του ηλεκτροφωτισμού των κυκλοφοριακών Συνδέσεων,

2. τη διεξαγωγή μετρήσεων κυκλοφορίας του οδικού δικτύου αρμοδιότητάς προς διαπίστωση του φόρτου κυκλοφορίας στο οδικό δίκτυο αρμοδιότητάς της Διεύθυνσης,
3. τον προγραμματισμό των αναγκών ηλεκτροφωτισμού και φωτεινής σηματοδότησης του οδικού δικτύου αρμοδιότητας της Διεύθυνσης. 

Στο Τμήμα Εξοπλισμού και Μηχανημάτων Έργων είναι αρμόδιο ιδίως για:

1. Tη διαχείριση και τη συντήρηση των μηχανημάτων έργων που κατά αρμοδιότητα ανήκουν στην Περιφέρεια και λειτουργούν σε επίπεδο Διεύθυνσης,
2. τον προγραμματισμό και την κίνηση των μηχανημάτων έργων και του εν γένει μηχανικού εξοπλισμού προς παροχή τεχνικών υπηρεσιών εκτελούμενων διααυτεπιστασίας,
3. τον έλεγχο και την παρακολούθηση των υλικών για τα έργα που εκτελεί. 

Το Γραφείο Γραμματειακής Υποστήριξης είναι αρμόδιο ιδίως για:

1. την οργάνωση, ταξινόμηση και τήρηση του πρωτοκόλλου καθώς και το φυσικό και ηλεκτρονικό αρχείο της Διεύθυνσης,
2. τη διεκπεραίωση και διακίνηση της αλληλογραφίας της Διεύθυνσης,
3. την επικύρωση, σύμφωνα με την κείμενη νομοθεσία, αντιγράφων και φωτοαντιγράφων, οποιονδήποτε εγγράφων ή δικαιολογητικών, τα οποία τηρούνται στο αρχείο της Διεύθυνσης,
4. το συντονισμό και την παρακολούθηση διοικητικών διαδικασιών σε δράσεις και προγράμματα της Διεύθυνσης, διασφαλίζοντας την τήρηση των προθεσμιών και την ομαλή υλοποίησή τους.